L'aeroporto di Zanzibar dispone di 2 terminal passeggeri distanti 100 metri l'uno dall'altro.
- Terminal 1 - non utilizzato dagli anni '70
- Terminal 2 - voli nazionali verso la Tanzania continentale, piccolo edificio più vecchio
- Terminal 3 - voli internazionali, edificio moderno e spazioso costruito nel 2022.
Per spostarsi a piedi tra i terminal occorrono 2 minuti.
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Trasferimento tra i voli
Sebbene l'aeroporto di Zanzibar non sia un importante hub di trasferimento, i trasferimenti da voli internazionali a voli nazionali verso la terraferma tanzaniana sono comuni.
In questo caso è sempre necessario passare l'immigrazione, ritirare i bagagli, camminare per 100 metri fino al terminal nazionale e rifare il check-in.
Si consiglia di mettere da parte un minimo di 5 ore per il trasferimento, a causa di possibili ritardi e lunghe code al controllo immigrazione.