L'aeroporto Manohar dispone di 1 moderno terminal comune a tutti i voli. La sala arrivi e i banchi del check-in si trovano al piano terra.
I controlli di sicurezza e i gate di partenza si trovano al 1° piano.
Il terminal è diviso in sezioni nazionali e internazionali, ma tutto è vicino e le distanze a piedi sono molto brevi.
Controllo immigrazione all'arrivo
Nonostante il fatto che l'aeroporto di Goa Manohar abbia pochissimi voli internazionali, all'arrivo ci sono spesso lunghe code al controllo immigrazione, che possono durare oltre 60 minuti.
Trasferimento tra i voli
L'aeroporto di Manohar non è un hub di trasferimento e quindi non dispone di servizi di trasferimento diretto.
Quando si prende una coincidenza, si deve sempre uscire dall'area di transito, attraversare l'area pubblica fino alla sala partenze, prendere la scala mobile fino al primo piano e passare i controlli di sicurezza.
Il tempo totale di trasferimento da un volo nazionale è di circa 30-40 minuti, mentre da un volo internazionale può richiedere più di 90 minuti a causa delle lente code all'immigrazione.
