I passeggeri dell'aeroporto di Brindisi sono serviti da un unico terminal che gestisce tutti i voli per tutte le destinazioni.
Hotel economici nel centro di Brindisi
I banchi del check-in si trovano al piano terra a destra, mentre gli arrivi sono al piano terra a destra. I controlli di sicurezza e l'area di transito si trovano al 1° piano, con scale mobili e ascensori che vi conducono.
Il terminal è molto piccolo e spesso affollato nella stagione estiva, con un numero minimo di posti a sedere. Presentarsi in aeroporto preferibilmente 2 ore prima della partenza. Questo tempo sarà sempre sufficiente.